Современный университет города Печ был основан в 1912 году и первоначально находился в Пожонь (нынешняя Братислава). После Первой мировой войны Пожонь был анексирован от Венгрии, и в 1921 году университет переехал в Печ, где он остается и по сей день. В 1951 году медицинский факультет университета был отделен, и до 2000 года был отдельным учреждением. В 1982 году университет получил имя Януса Паннониуса. Настоящий университете города Печ был создан 1 января 2000 года , путем слияния университета Януса Паннониуса, Медицинского университета города и педагогического колледжа.
Университет предлагает широкий спектр обучения и образовательных программ, обеспечение высокого уровня передачи знаний и исследований. С его студентов и около 2000 преподавателей и исследователей влияния Университета Печ простирается далеко за пределы границ города Печ